به جهت جایگاه قانونی صندوق (ماده 100 قانون برنامه سوم توسعه و همچنین ماده 45 برنامه چهارم توسعه اقتصادی) و بر اساس اختیارات مندرج در اساسنامه مصوب هیئت محترم وزیران، صندوق پژوهش و فناوری تاپ می‌تواند در راستای رفع نیازهای پژوهشی و فناوری‌های مورد نظر دستگاه‌های اجرایی، در کلیه حمایت‌های مالی دولت از اشخاص حقیقی و حقوقی (که از طریق ساختارهای دولتی مشکل بوده یا قابل انجام نمی‌باشد)، به عنوان بازوی مالی عمل نماید. به این ترتیب کلیه خدماتی که توسط صندوق جهت تجاری‌سازی پژوهش و فناوری طراحی گردیده است بصورت یک بسته حمایتی در اختیار دستگاه اجرایی قرار می‌گیرد.
عاملیت اعطای تسهیلات و کمک‌های دستگاه اجرایی به اشخاص حقیقی و حقوقی
با توجه به ساختار تخصصي و قابليت هاي صندوق پژوهش و فناوري تاپ در شناسايي، ارزيابي و سرمايه گذاري در شركت هاي دانش بنيان، اين صندوق آمادگي دارد تا با پذيرش عامليت دستگاه ها و ارگان هاي دولتي و غيردولتي، به ارائه اين خدمات به آن دستگاه ها پرداخته و با انتخاب شركت هاي مورد نظر، به توزيع وجوه اداره شده به اين شركت ها بپردازند. این صندوق با پشتوانه مشاوره فني برگرفته از اساتيد و دانشجويان و همچنين با استفاده از كارشناسان زبده در امر ارزيابي طرح و امور شركت داري، اين قابليت را دارد تا عامليت وجوه اداره شده آنها را برای توسعه كسب و كارهاي دانش بنيان مرتبط با حوزه فعالیتشان را به عهده بگيرد.
ارزیابی و ارزشگذاری طرح‌های معرفی شده بر اساس روشهای علمی و معیارهای مشخص شده توسط دستگاه اجرایی
پذیرش ریسک پرداخت تسهیلات توسط صندوق پس از ارزیابی طرح‌ها.
نظارت بر اجرای طرح‌ها و پروژه‌های تحت حمایت دستگاه‌ها.
افزایش سرعت عمل در اجرای برنامه ها و ارائه خدمات با کیفیت بالا به علت کاهش بروکراسی مالی و اداری.
ترغیب و ارائه مدل های متنوع حمایتی به دستگاه های اجرایی جهت سرمایه گذاری مطمئن و پایدار به جای کمک بلاعوض به طرح های فناور.
تسهیل در اشتغال فارغ التحصیلان با ارائه مدل ها و مکانیزم های موجود.
امکان بازگشت برخی اعتبارات پرداخت شده به متخصصان، فارغ‌التحصیلان و شرکت‌های دانش بنیان (بر اساس ابزارهای مالی صندوق) فراهم می‌گردد.